彼は以前からいびきが激しく、最近は息が止まります。
でも本人は眠りで悩んでいることは何もないので、また今までずっとそうしてきたようですから心配しすぎかなとも思いますが・・・
指摘してあげたほうが良いのでしょうか？

本当にひどい無呼吸症の方でも、自分では気が付かない方が多いようです。

結果的にご家族の方に指摘されて仕方なく受診されることが多いので、やはり指摘してあげたほうが良いと思います。